درمانگاه تخصصی و فوق تخصصی بیمارستان سیدالشهداء یزد در کنار این بیمارستان واقع است. این درمانگاه شامل کلینیک­ های متعدد و تخصصی با پزشکان حاذق و مجرب در حال خدمت رسانی به بیماران است . کادر درمانگاه کوشیده است تا با ایجاد یک محیط آرام با بهترین پزشکان و پیشرفته ترین تجهیزات در سریع ترین زمان ممکن به بیماران رسیدگی شود.